通常不存在艾灸最主要的五個穴位，可以進行艾灸的穴位包括足三里、命門、關元、氣海、中脘等。
1、足三里：位于小腿外側，是足陽明胃經的主要穴位之一。艾灸此穴能調節機體免疫力、增強抗病能力，具有防病保健的作用。
2、命門：位于腰部，第二腰椎棘突下凹陷中。艾灸命門穴可溫補腎陽，固本培元，有助于增強體質。
3、關元：位于下腹部，臍下三寸處。艾灸關元穴能培元固本、補益下焦，對多種慢性疾病有輔助治療作用。
4、氣海：位于下腹部，臍下一寸五分處。艾灸氣海穴能溫陽益氣、扶正固本，對氣虛體弱者尤為適宜。
5、中脘：位于上腹部，前正中線上，臍上四寸處。艾灸中脘穴能溫胃散寒、行氣止痛，對消化系統疾病如胃痛、胃脹等有顯著療效。
艾灸時應選擇合適的穴位和適當的灸法，避免灼傷皮膚。艾灸后應注意保暖，避免受寒受風。孕婦、哺乳期婦女、嚴重心臟病患者等人群應在醫生指導下進行艾灸。